截至2023年9月，鄂尔多斯国际机场运营航线共74条，通达国内城市：北京、杭州、郑州、深圳、广州、三亚、上海、太原、昆明、武汉、合肥、西安、南昌、南京、珠海、哈尔滨、银川、济南、西宁、青岛、兰州、邯郸、温州、济宁、厦门、长沙、石家庄、天津、长春、重庆、呼和浩特、延安、贵阳、临汾、沈阳、成都、烟台、大连、锡林浩特、鄂州、赤峰、通辽、佛山、芜湖、菏泽、南阳、十堰、桂林、常州、秦皇岛、阜阳、揭阳潮汕、徐州、张家界、岳阳、吐鲁番、泸州、盐城、海口、乌兰浩特、井冈山、海拉尔共计62个通航城市。